Er is een klein betekenisverschil.

 

destijds

toen (een meer precieze verwijzing)
Het gebeurde in de jaren negentig; destijds waren wij ook student.

 

indertijd

vroeger (een ruimere verwijzing)
Waarom zijn indertijd de gele bordjes snelheidsbeperking vervangen?

 

Dit onderscheid raakt echter steeds meer in onbruik. Het aardige van dit woordpaar is dat je er zo goed aan kunt zien dat het woordje tijd vroeger twee geslachten had: mannelijk (des) en vrouwelijk (der).